Issue de la littérature psychanalytique lacanienne, la distinction entre propriétés de la matière, fonction et fonctionnement se révèle heuristique. Dans cette étude, nous formulons à partir de cette trilogie l’hypothèse d’une hétérogénéité épistémologique et ontologique entre ces différentes dimensions du sujet. Par méthodologie, nous confrontons ces trois dimensions aux apories théoriques de Freud développées dans l’Esquisse d’une psychologie scientifique. Nos résultats montrent que la distinction entre propriétés de la matière, fonction et fonctionnement amène une émergence paradoxale. La conception du sujet comme étant émergent est un paradoxe nécessaire : elle restitue l’hétérogénéité épistémologique entre neurosciences et psychanalyse, et rend compte de la discontinuité du sujet avec son expérience sur le plan ontologique. La capacité de l’humain à conférer un sens aux événements de sa vie dans l’après-coup produit un effet rétroactif sur ses propriétés matérielles, avec des implications sur la causalité du sujet. Nos conclusions suggèrent que la notion de paradoxe est essentielle à la compréhension du fonctionnement du sujet conditionné par ses propriétés matérielles. Ainsi, le sens qu’il octroie à son existence interroge la prémisse fréquente en neurosciences du sujet comme étant un produit de son cerveau.